Zabezpečení Docker zahrnuje více vrstev — minimální a důvěryhodné image, spouštění bez root práv, skenování zranitelností, správu tajemství, limity prostředků a schopností a zpevňování hostitele/démona. Bezpečnost kontejneru je důležitá, protože zranitelnosti mohou ovlivnit jak kontejner, tak i hostitele.
