Osiguravanje Docker-a uključuje više slojeva — minimalne i pouzdane slike, pokretanje kao obični korisnik, skeniranje ranjivosti, upravljanje tajnama, ograničenja resursa i mogućnosti te ojačanje hosta/demona. Sigurnost kontejnera je važna jer ranjivosti mogu utjecati na kontejner i na host.
