A Docker védelme több szinten történik — minimális és megbízható images, non-root felhasználóként futtatás, sebezhetőségi vizsgálat, titkos adatok kezelése, erőforrás és capability korlátozások, valamint host/daemon hardening. A konténer biztonsága fontos, mert a sebezhetőségek a konténert és a hosztot egyaránt érinthetik.
